企业以社会科研教学单位为依托，开创了彩棉研发技术产业的先河，目前与中科院、中国农业大学、中国农科院、新疆农科院、新疆农垦科学院、东华大学、西南大学、新疆大学、新疆农业大学、石河子大学等多家科研机构建立了广泛的研究合作。
目前主要科研平台有：
企业博士后科研工作站
国家认定企业技术中心
全国纤维标准化技术委员会天然彩色棉分技术委员会
中国棉花学会天然彩色棉专业委员会
新疆天然彩色棉花研究所
新疆彩色棉工程技术研究院有限公司
中彩股份先后与中科院、中国农业大学、中国农科院、新疆农科院、新疆农垦科学院、东华大学、西南大学、新疆大学、新疆农业大学、石河子大学等多家科研机构建立了广泛的研究合作，形成了以企业为主体、以社会科研教学单位为依托的彩棉研发技术创新体系。先后获得国家发明二等奖、国家科技进步二等奖等一大批国家级科技奖励。
14个彩色棉新品种
12件植物新品种权
8项科技进步奖
1. 搭建国家级研发合作平台
拥有国家认定企业技术中心、企业博士后科研工作站、国家科技兴贸创新基地，承担了全国纤维标准化技术委员会天然彩色棉分技术委员会和中国棉花学会天然彩色棉花专业委员会秘书处工作，为在全国范围内开展天然彩棉产业领域的科技攻关合作奠定了坚实基础。
2. 完善的科研技术研发体系
实施产业重大科技攻关项目，增强技术研发创新能力，形成卓越的品种研发能力提升产业核心竞争力。
3. 拥有优质高产的彩棉新品种
成功培育出具有自主知识产权的十四个彩色棉花品种，彩棉品种总数分别占国内37个、世界41个品种总数的32.4％和29.3％。建立彩棉品种分子特征图谱、彩色棉品种鉴定的RAPD反应体系。彩棉新品系的绒长已达中长绒水平，抗病、抗虫彩棉新品系已经获得，彩棉新品系的衣分已突破大关。
4. 率先制定天然彩色棉产业标准体系
制定了天然彩棉6大类36项标准，实施彩棉产业国家和行业标准，实现彩棉产业技术研发、标准化和产业化的有机衔接和协调发展，强化标准化工作对彩棉研发专业化、种子产业化、种植规模化、管理科学化、产品标准化的支撑保障作用，促进彩棉产业生产技术的规范化、系统化、科学化和集成化，提升标准化发展的整体质量效益，建立完备的天然彩棉标准体系，提高彩棉标准质量水平，夯实彩棉标准化发展基础。